20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1029 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  99.17 
 
 
241 aa  474  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  65.12 
 
 
242 aa  276  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  53.95 
 
 
229 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  42.79 
 
 
240 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  43.5 
 
 
242 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  46.08 
 
 
244 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  32.34 
 
 
219 aa  95.1  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  32.66 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  26.67 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  41.94 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5330  hypothetical protein  28 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  38.46 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  27.27 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03813  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4427  hypothetical protein  24.89 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4287  putative secreted protein  24.44 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0783  polyferredoxin-like protein  30.77 
 
 
336 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0113  putative secreted protein  24.32 
 
 
213 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>