16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2976 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  38.56 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  35.98 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  32.78 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1146  hypothetical protein  27.12 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  25.59 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  24.65 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  25.75 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  25.12 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  28.81 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  27.47 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1639  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  23.53 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  26.25 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  27.16 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  22.77 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  22.64 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>