17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2393 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  30.26 
 
 
240 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  32.5 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  32 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  31.55 
 
 
242 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  32.18 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  29.33 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  30.05 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  27.5 
 
 
229 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  24.65 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  23.41 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  26.19 
 
 
237 aa  58.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5330  hypothetical protein  26.29 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03813  hypothetical protein  36.99 
 
 
309 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  23.74 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  39.62 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0113  putative secreted protein  23.08 
 
 
213 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>