14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5330 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5330  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4427  hypothetical protein  28.43 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  26.79 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4287  putative secreted protein  28.43 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0113  putative secreted protein  28.43 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  29.27 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03813  hypothetical protein  28.95 
 
 		 309 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  22.32 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  27.36 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  25.21 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  31.05 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>