13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0724 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  53.33 
 
 
241 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  52.86 
 
 
241 aa  215  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  51.9 
 
 
242 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  39.82 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  39.09 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  40.65 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  26.73 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  27.5 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  22.77 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5330  hypothetical protein  33.04 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  33.85 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  24.14 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>