15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0263 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  44.87 
 
 
238 aa  195  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  38.4 
 
 
241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  35.98 
 
 
232 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1146  hypothetical protein  34.02 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409017  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  28.19 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  26.19 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  24.69 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1639  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  21.31 
 
 
314 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  25.31 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  32.98 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03813  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  23.61 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1092  hypothetical protein  23.53 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  23.39 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>