More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4164 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  77.75 
 
 		 428 aa  682    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  73.81 
 
 		 429 aa  659    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  72.92 
 
 		 431 aa  650    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  72.79 
 
 		 429 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  95.33 
 
 		 428 aa  848    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  100 
 
 		 428 aa  883    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  75.97 
 
 		 430 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  74.12 
 
 		 426 aa  659    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  73.1 
 
 		 428 aa  646    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  73.8 
 
 		 430 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  73.56 
 
 		 443 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  72.45 
 
 		 432 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 429 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  72.21 
 
 		 428 aa  644    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  72.99 
 
 		 1111 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  72.99 
 
 		 1111 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  69.41 
 
 		 426 aa  631  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  73.9 
 
 		 1110 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  68.72 
 
 		 425 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  68.72 
 
 		 425 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  70.5 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  72.66 
 
 		 1111 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  68.48 
 
 		 425 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  68.25 
 
 		 425 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  68.25 
 
 		 425 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  68.48 
 
 		 425 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  68.48 
 
 		 425 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  68.48 
 
 		 425 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  68.16 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  68.48 
 
 		 425 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  68.01 
 
 		 425 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  70.73 
 
 		 432 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  67.3 
 
 		 425 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  72.66 
 
 		 430 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  68.09 
 
 		 431 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  69.78 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  67.92 
 
 		 443 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  66.98 
 
 		 434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  71.08 
 
 		 461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  66.98 
 
 		 434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  66.43 
 
 		 434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  67.3 
 
 		 422 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  68.93 
 
 		 492 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  67.05 
 
 		 443 aa  598  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  68.03 
 
 		 435 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 475 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 475 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  68.03 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  67.55 
 
 		 434 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4706  isocitrate lyase  67.06 
 
 		 438 aa  596  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  68.03 
 
 		 435 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  68.03 
 
 		 435 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  65.81 
 
 		 432 aa  594  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 435 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 435 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 435 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0629  isocitrate lyase  66.9 
 
 		 428 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0649  isocitrate lyase  66.9 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.966467 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 435 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  67.79 
 
 		 435 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  67.07 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0636  isocitrate lyase  66.9 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3602  isocitrate lyase  64.77 
 
 		 441 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2860  isocitrate lyase  65.2 
 
 		 439 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  66.83 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  64.97 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  68.35 
 
 		 422 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5339  isocitrate lyase  67.52 
 
 		 434 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641563  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  65.27 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3687  isocitrate lyase  64.55 
 
 		 441 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.978448  normal  0.141916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3196  isocitrate lyase  64.48 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0249331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  64.73 
 
 		 439 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2101  isocitrate lyase  64.97 
 
 		 439 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0073  isocitrate lyase  69.38 
 
 		 452 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0698  isocitrate lyase  68.2 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3389  isocitrate lyase  64.77 
 
 		 441 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0801  isocitrate lyase  66.2 
 
 		 428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4116  isocitrate lyase  64.55 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3364  isocitrate lyase  64.32 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113037  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  66.82 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0107  isocitrate lyase  65.27 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19864  normal  0.815219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0711  isocitrate lyase  67.39 
 
 		 438 aa  578  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2855  isocitrate lyase  64.73 
 
 		 439 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10474  isocitrate lyase icl  65.27 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1748  isocitrate lyase  64.55 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.191807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0311  isocitrate lyase  68.05 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.251887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0308  isocitrate lyase  66.91 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  65.29 
 
 		 439 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2766  isocitrate lyase  65.13 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0008216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3668  isocitrate lyase  64.27 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  65.13 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3982  isocitrate lyase  64.9 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  64.91 
 
 		 450 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4469  isocitrate lyase  64.9 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0668028  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4249  isocitrate lyase  64.9 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4015  isocitrate lyase  64.9 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.857815  normal  0.048313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0583  isocitrate lyase  65.63 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>