33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3759 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  85.51 
 
 		 503 aa  822    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  983    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  30.21 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  36.14 
 
 		 519 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  36.4 
 
 		 537 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  31.47 
 
 		 497 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  26.37 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  30.75 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  28.65 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  30.15 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  28.97 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  26.77 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  27.17 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  27.48 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  27.84 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  28.3 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  24.54 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  29.75 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  26.09 
 
 		 493 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  25.48 
 
 		 484 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  29.8 
 
 		 509 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  26.92 
 
 		 493 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  26.82 
 
 		 498 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  24.49 
 
 		 653 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  25.59 
 
 		 746 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  35.26 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  28.69 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  28.96 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  23.58 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  28.85 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  27.7 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  36.54 
 
 		 484 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  23.85 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>