33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1125 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  992    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  85.51 
 
 		 499 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  31.22 
 
 		 504 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  36.08 
 
 		 537 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  35.94 
 
 		 519 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  31.87 
 
 		 497 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  25.79 
 
 		 518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  29.23 
 
 		 511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  28.48 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  27.84 
 
 		 482 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  26.46 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  25.96 
 
 		 554 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  29.76 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  26.2 
 
 		 514 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  27.23 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  27.27 
 
 		 496 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  27.29 
 
 		 495 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  26.96 
 
 		 653 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  29.35 
 
 		 493 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  30.17 
 
 		 510 aa  89.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  24.09 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  25.7 
 
 		 746 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  34.57 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  23.87 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  34.3 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  22.22 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  31.03 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  28.73 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  32.7 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  27.72 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  27.68 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  36.54 
 
 		 484 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  24.32 
 
 		 322 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>