31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1124 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1025    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  83.2 
 
 		 537 aa  731    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  35.61 
 
 		 503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  37.21 
 
 		 499 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  28.57 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  31.72 
 
 		 497 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  23.33 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  27.02 
 
 		 527 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  26.07 
 
 		 554 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  27.29 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  24.95 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  26.41 
 
 		 511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  24.9 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  28.12 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  25.26 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  27.66 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  26.89 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  28.39 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  27.42 
 
 		 746 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  25.63 
 
 		 485 aa  72  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  27.06 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  25.57 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  27.54 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  26.99 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  24.7 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  29.61 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  24.7 
 
 		 322 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  25.11 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  30.08 
 
 		 498 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  29.06 
 
 		 492 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  24.17 
 
 		 509 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>