32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4091 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  956    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  67.68 
 
 		 496 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  68.7 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  57.14 
 
 		 493 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  52.39 
 
 		 484 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  46.71 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  48.04 
 
 		 478 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  46.9 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  40.36 
 
 		 510 aa  296  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  33.7 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  25.51 
 
 		 518 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  28.57 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  26.78 
 
 		 527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  28.27 
 
 		 514 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  28.48 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  26.7 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  26.03 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  30.84 
 
 		 477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  29.53 
 
 		 540 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  27.02 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  26.34 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  25.16 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  23.49 
 
 		 504 aa  89.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  34.68 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  34.15 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  28.9 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  28.04 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  23.15 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  27.65 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  25.38 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  29.12 
 
 		 746 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  23.32 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>