35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3128 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  969    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  28.51 
 
 
518 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  30.53 
 
 
485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  28.84 
 
 
527 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  28.95 
 
 
511 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  25.79 
 
 
504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  28.79 
 
 
746 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  28.33 
 
 
498 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  26.51 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  29.08 
 
 
514 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  29.62 
 
 
499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  28.16 
 
 
503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  27.23 
 
 
484 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  28.49 
 
 
496 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  28.22 
 
 
510 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  27.51 
 
 
519 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  27.02 
 
 
484 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  27.31 
 
 
537 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  27.66 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  25 
 
 
492 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  24 
 
 
653 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  22.38 
 
 
497 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  26.88 
 
 
495 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  26.1 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  30.31 
 
 
477 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  24.52 
 
 
493 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  31.97 
 
 
509 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  28.2 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  22.29 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  23.03 
 
 
322 aa  67  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  31.09 
 
 
509 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  30.89 
 
 
540 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  28.7 
 
 
483 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  32.43 
 
 
484 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0890  hypothetical protein  41.67 
 
 
502 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>