27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3001 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  987    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  85.46 
 
 
509 aa  796    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  45.34 
 
 
540 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  30.06 
 
 
496 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  25.51 
 
 
493 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  25.15 
 
 
511 aa  91.3  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  24.9 
 
 
527 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  31.4 
 
 
510 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  34.98 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  22.18 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  26 
 
 
482 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  27.42 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  25.48 
 
 
514 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  28.87 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  33.91 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  27.8 
 
 
503 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  25.65 
 
 
485 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  24.59 
 
 
498 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  25.5 
 
 
653 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  23.81 
 
 
504 aa  57  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  30.12 
 
 
498 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  41.07 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  23.4 
 
 
484 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  22.66 
 
 
444 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  30.77 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  28.22 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  50 
 
 
477 aa  43.5  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>