34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3427 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  78.02 
 
 		 496 aa  712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  967    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  68.5 
 
 		 492 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  61.46 
 
 		 493 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  54.05 
 
 		 484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  45.66 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  47.75 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  47.54 
 
 		 498 aa  339  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  40.72 
 
 		 510 aa  289  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  32.67 
 
 		 493 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  26.53 
 
 		 518 aa  153  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  28.43 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  27.93 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  26.32 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  27.33 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  29.34 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  28.63 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  28.45 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  26.91 
 
 		 503 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  26.59 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  23.47 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  37.28 
 
 		 509 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  35.48 
 
 		 509 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  22.29 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  25.66 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  32.2 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  27.52 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  23.44 
 
 		 746 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  23.59 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  26.1 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  27.43 
 
 		 537 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  25.94 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0889  hypothetical protein  27.05 
 
 		 480 aa  47.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  25.41 
 
 		 519 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>