33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1959 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  964    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  78.02 
 
 		 495 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  61.89 
 
 		 493 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  66.8 
 
 		 492 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  53.64 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  46.91 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  47.71 
 
 		 478 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  47.43 
 
 		 498 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  41.77 
 
 		 510 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  32.53 
 
 		 493 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  26.42 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  27.2 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  29.78 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  33.12 
 
 		 514 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  27.21 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  28.09 
 
 		 485 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  27.84 
 
 		 499 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  27.98 
 
 		 482 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  26.83 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  28.14 
 
 		 540 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  24.15 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  22.08 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  26.58 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  27.94 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  34.34 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  32.57 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  24.19 
 
 		 746 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  24.06 
 
 		 653 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  27.43 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  26.53 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  27.33 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  21.98 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  25.56 
 
 		 322 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>