34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3211 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1033    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  48.92 
 
 		 527 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  43.82 
 
 		 518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  32.8 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  30.74 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  32.7 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  29.32 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  31.34 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  23.99 
 
 		 504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  28.54 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  30.1 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  25.68 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  27.78 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  30.15 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  30.02 
 
 		 477 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  28.63 
 
 		 493 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  27.03 
 
 		 653 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  26.46 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  27.16 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  25.67 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  23.42 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  29.36 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  28.54 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  26.04 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  24.6 
 
 		 497 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  23.61 
 
 		 746 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  27.27 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  34.25 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  27.33 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  29.08 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  29.55 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  25.64 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  25.55 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  32.26 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>