19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0189 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1123    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  25.65 
 
 
503 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  24.07 
 
 
504 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  19.75 
 
 
518 aa  97.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  25.14 
 
 
497 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  27.37 
 
 
519 aa  90.9  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  21.31 
 
 
514 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  23.66 
 
 
499 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  20.84 
 
 
527 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  24.21 
 
 
537 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  22.25 
 
 
482 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  29.46 
 
 
511 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  22.59 
 
 
498 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  22.82 
 
 
653 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  21.37 
 
 
484 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  22.41 
 
 
493 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  21.14 
 
 
485 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  21.24 
 
 
483 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  21.61 
 
 
746 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>