28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3760 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  83.2 
 
 		 519 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1056    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  35.15 
 
 		 503 aa  243  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  36.2 
 
 		 499 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  27.89 
 
 		 504 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  31.38 
 
 		 497 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  27.67 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  23.95 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  26.27 
 
 		 511 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  24.18 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  26.88 
 
 		 482 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  24.22 
 
 		 554 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  25.51 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  27.27 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  25.52 
 
 		 493 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  26.32 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  26.71 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  25.1 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  25.51 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  26.68 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  28.34 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  27.37 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  27.39 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  26.67 
 
 		 322 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  26.81 
 
 		 477 aa  50.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  23.38 
 
 		 653 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  23.85 
 
 		 509 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  28.69 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>