34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1756 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1036    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  34.65 
 
 		 518 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  34.59 
 
 		 527 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  32.41 
 
 		 514 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  28.63 
 
 		 482 aa  166  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  32.52 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  28.42 
 
 		 444 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  26.92 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  28.33 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  29.78 
 
 		 496 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  30.12 
 
 		 503 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  28.07 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  28.48 
 
 		 495 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  26.79 
 
 		 498 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  27.94 
 
 		 484 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  28.4 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  27.51 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  28.07 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  25.93 
 
 		 537 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  23.41 
 
 		 497 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  24.84 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  22.22 
 
 		 653 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  30.77 
 
 		 492 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  37.43 
 
 		 540 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  24.56 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  22.93 
 
 		 746 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  22.52 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  33.7 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  30.57 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  34.18 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  31.02 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  24.02 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  27.03 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  35.59 
 
 		 484 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>