32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3257 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  975    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  78.42 
 
 		 484 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  68.26 
 
 		 478 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  54.66 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  47.73 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  48.55 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  47.31 
 
 		 495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  46.06 
 
 		 492 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  38.03 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  32.22 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  26.74 
 
 		 518 aa  159  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  26.86 
 
 		 511 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  29.79 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  25.32 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  25.51 
 
 		 527 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  28.11 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  24.84 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  27.8 
 
 		 514 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  28.79 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  28.78 
 
 		 503 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  29.85 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  25.81 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  24.74 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  28.43 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  22.94 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  34.87 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  25.25 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  32.93 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  30.45 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  25.57 
 
 		 653 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  25.1 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  21.94 
 
 		 746 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>