34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2695 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  100 
 
 
527 aa  1073    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  50.39 
 
 
518 aa  535  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  48.92 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  35.07 
 
 
511 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  29.26 
 
 
482 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  29.51 
 
 
485 aa  181  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  30.37 
 
 
510 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  26.95 
 
 
496 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  27.58 
 
 
499 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  27.09 
 
 
503 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  24.58 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  26.73 
 
 
495 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  27.61 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  28.48 
 
 
484 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  24.37 
 
 
498 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  25.99 
 
 
493 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  24.69 
 
 
444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  27.56 
 
 
537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  25 
 
 
497 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  26.07 
 
 
540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  27.48 
 
 
478 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  27.02 
 
 
519 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  21.79 
 
 
653 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  24.7 
 
 
477 aa  97.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  25.84 
 
 
509 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  23.3 
 
 
746 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  28.28 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  26.35 
 
 
484 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  25.05 
 
 
498 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  23.72 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  20.84 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  22.99 
 
 
322 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  21.05 
 
 
483 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1717  hypothetical protein  29.7 
 
 
152 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.832469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>