33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0766 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  932    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  30.64 
 
 
485 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  27.29 
 
 
444 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  30.3 
 
 
482 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  30.93 
 
 
493 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  29.2 
 
 
510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  31.34 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  24.74 
 
 
527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  25.51 
 
 
504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  30.02 
 
 
484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  29.14 
 
 
496 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  30.75 
 
 
498 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  29.33 
 
 
495 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  28.87 
 
 
478 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  27.56 
 
 
493 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  23.89 
 
 
518 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  25.66 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  28.9 
 
 
519 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  24.47 
 
 
498 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  32.78 
 
 
492 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  27.37 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  24.79 
 
 
499 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  28.54 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  24.58 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  23.98 
 
 
653 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0889  hypothetical protein  26.15 
 
 
480 aa  60.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  25.87 
 
 
537 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  23.49 
 
 
497 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  26.99 
 
 
509 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  26.22 
 
 
509 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  31.55 
 
 
540 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  24.83 
 
 
746 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  24 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>