28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0780 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  100 
 
 
746 aa  1511    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  28.29 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  23.54 
 
 
518 aa  95.5  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  23.37 
 
 
511 aa  87.8  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  31.85 
 
 
503 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  24.22 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  27.14 
 
 
504 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  22.49 
 
 
527 aa  71.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  24.42 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  23.21 
 
 
496 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  21.88 
 
 
653 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  23.3 
 
 
514 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  23.53 
 
 
485 aa  64.3  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  20.04 
 
 
444 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  22.27 
 
 
493 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  24.89 
 
 
498 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  23.84 
 
 
497 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  29.1 
 
 
492 aa  54.7  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  22.57 
 
 
483 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  25.31 
 
 
493 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  31.03 
 
 
509 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  24.85 
 
 
519 aa  47.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  25.59 
 
 
537 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  21.47 
 
 
484 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  21.29 
 
 
484 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  21.71 
 
 
322 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  28.96 
 
 
540 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
265 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>