33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2540 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2540  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1023    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175652  hitchhiker  0.00937199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  41.77 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  39.45 
 
 		 495 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  40.28 
 
 		 492 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  36.92 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  38.05 
 
 		 478 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  37.37 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3198  hypothetical protein  38.79 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293913  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  31.32 
 
 		 493 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3257  hypothetical protein  38.03 
 
 		 498 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  28.81 
 
 		 518 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  32.39 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  30.42 
 
 		 527 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  31.62 
 
 		 514 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  28.9 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  27.45 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  27.33 
 
 		 482 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  30.23 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  29.05 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  25.68 
 
 		 498 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  21.8 
 
 		 504 aa  87.8  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  31.3 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  30.8 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  38.18 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  25.45 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3001  hypothetical protein  29.67 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.995125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  25 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  26.46 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  22.98 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3760  hypothetical protein  27.58 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.015689  unclonable  0.0000216069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1124  hypothetical protein  26.92 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.862042  normal  0.877576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  23.1 
 
 		 746 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  23.49 
 
 		 653 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>