More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2337 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2337  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 432 aa  847    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  75.76 
 
 		 496 aa  633  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.44 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199948  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  26.44 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  42.47 
 
 		 255 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3823  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.18 
 
 		 261 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0827889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0887  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.33 
 
 		 261 aa  111  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.63 
 
 		 260 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0612  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.66 
 
 		 274 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.356127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  40.27 
 
 		 250 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.72 
 
 		 251 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.28 
 
 		 247 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.57 
 
 		 256 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1765  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.51 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.560778  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.77 
 
 		 272 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000452495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  31.34 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  31.34 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.3 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.1 
 
 		 247 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.69 
 
 		 294 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  32.16 
 
 		 250 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  32.56 
 
 		 275 aa  103  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.1 
 
 		 256 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.94 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.74 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11661  23S rRNA methyltransferase tsnR  35.16 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  40.41 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  41.78 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  41.78 
 
 		 248 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  41.78 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1890  RNA methyltransferase  36.49 
 
 		 253 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.575059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  41.78 
 
 		 248 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.58 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.91 
 
 		 246 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3029  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.16 
 
 		 264 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.068461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.91 
 
 		 246 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.91 
 
 		 246 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0856  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.03 
 
 		 296 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.91 
 
 		 247 aa  99.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.67 
 
 		 270 aa  99.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.6 
 
 		 251 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  34.93 
 
 		 238 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.67 
 
 		 250 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  36.24 
 
 		 251 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.31 
 
 		 246 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.06 
 
 		 289 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.14 
 
 		 269 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  37.09 
 
 		 250 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.79 
 
 		 250 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.67 
 
 		 250 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.91 
 
 		 248 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0991  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase, putative  30.4 
 
 		 255 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.27 
 
 		 261 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.62 
 
 		 246 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0988  tRNA/rRNA methyltransferase  41.06 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1105  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.4 
 
 		 255 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.919918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2268  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 248 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144304  normal  0.908224 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  27.99 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.12 
 
 		 254 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  32.52 
 
 		 238 aa  97.8  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.04 
 
 		 247 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.04 
 
 		 247 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  37.42 
 
 		 234 aa  98.2  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  37.16 
 
 		 245 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  36.24 
 
 		 263 aa  97.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  36.99 
 
 		 249 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0729  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.24 
 
 		 246 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.55 
 
 		 251 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.24 
 
 		 246 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.24 
 
 		 246 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  36.65 
 
 		 249 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.09 
 
 		 246 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.93 
 
 		 245 aa  97.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  37.58 
 
 		 247 aa  97.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.19 
 
 		 246 aa  96.7  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.55 
 
 		 246 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.89 
 
 		 251 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  41.06 
 
 		 249 aa  96.7  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3539  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.32 
 
 		 252 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0474859  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0658  RNA methyltransferase  44.52 
 
 		 271 aa  96.3  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 248 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  36.3 
 
 		 244 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2415  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.57 
 
 		 265 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  36.02 
 
 		 249 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2232  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.57 
 
 		 256 aa  96.3  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.73 
 
 		 246 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.55 
 
 		 246 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  37.41 
 
 		 247 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  37.41 
 
 		 247 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  38.36 
 
 		 248 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.85 
 
 		 247 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>