32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0852 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3887  hypothetical protein  62.91 
 
 
756 aa  882    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  100 
 
 
699 aa  1380    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
686 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
729 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  28.42 
 
 
710 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  28.52 
 
 
687 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
680 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  28.18 
 
 
678 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 
680 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  23.55 
 
 
734 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  28.67 
 
 
764 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  25.72 
 
 
725 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  25.21 
 
 
709 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  24.78 
 
 
782 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  25.94 
 
 
794 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
718 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  25 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0086  hypothetical protein  24.83 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  24.54 
 
 
406 aa  64.7  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
452 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2032  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.53 
 
 
482 aa  57.4  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0062  hypothetical membrane spanning protein  25.53 
 
 
482 aa  57.4  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3502  hypothetical protein  29.94 
 
 
527 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.7799500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
692 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3113  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
610 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.264038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.27 
 
 
408 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0127  hypothetical protein  26.64 
 
 
449 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  24.09 
 
 
463 aa  47  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5398  hypothetical protein  25.11 
 
 
425 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0219  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  25 
 
 
676 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  27.91 
 
 
399 aa  44.3  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2611  hypothetical protein  29.65 
 
 
441 aa  43.9  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>