26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3907 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  77.2 
 
 		 709 aa  1048    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  100 
 
 		 725 aa  1436    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  43.36 
 
 		 678 aa  508  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 686 aa  184  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  29.93 
 
 		 710 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  29.93 
 
 		 687 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 680 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 680 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 692 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  27.29 
 
 		 718 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3887  hypothetical protein  25.46 
 
 		 756 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 729 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  24.28 
 
 		 734 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  25.37 
 
 		 699 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  29.79 
 
 		 794 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  27.2 
 
 		 782 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 452 aa  53.9  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 4079 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  26.95 
 
 		 735 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.94 
 
 		 408 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42 
 
 		 632 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0672  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 192 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  23.68 
 
 		 406 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0389  hypothetical protein  23.6 
 
 		 403 aa  44.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000244478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1056  hypothetical protein  24.62 
 
 		 428 aa  43.9  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  24.87 
 
 		 399 aa  43.9  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>