22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3210 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  77.2 
 
 
725 aa  1006    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  100 
 
 
709 aa  1403    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  44.33 
 
 
678 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
686 aa  200  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  30.03 
 
 
710 aa  193  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  30.41 
 
 
687 aa  167  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.39 
 
 
680 aa  127  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
680 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
692 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
729 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  24.57 
 
 
734 aa  97.8  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
718 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3887  hypothetical protein  25.38 
 
 
756 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  30.55 
 
 
699 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  29.43 
 
 
794 aa  67.4  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  27.09 
 
 
782 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
452 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  24.78 
 
 
406 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0389  hypothetical protein  24.06 
 
 
403 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000244478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3053  hypothetical protein  22.5 
 
 
419 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  27.24 
 
 
764 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  27.78 
 
 
735 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>