27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2659 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
718 aa  1433    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  76.08 
 
 
729 aa  1024    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.49 
 
 
680 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  37.57 
 
 
680 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  29.34 
 
 
710 aa  181  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  30.87 
 
 
687 aa  177  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  29.08 
 
 
734 aa  173  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  28.48 
 
 
794 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  29.11 
 
 
782 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
686 aa  151  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  27.81 
 
 
764 aa  147  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  26.65 
 
 
678 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
692 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  27.64 
 
 
725 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  27.02 
 
 
709 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3887  hypothetical protein  25.03 
 
 
756 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  26.47 
 
 
699 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  26.46 
 
 
406 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1056  hypothetical protein  30.22 
 
 
428 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2611  hypothetical protein  27.08 
 
 
441 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2825  hypothetical protein  27.49 
 
 
942 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3113  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
610 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.264038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  22.81 
 
 
422 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  29.29 
 
 
399 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4800  hypothetical protein  24.18 
 
 
367 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0876  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
430 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000359561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>