21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3887 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  63.05 
 
 		 699 aa  859    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3887  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1497    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  25.89 
 
 		 710 aa  108  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  24.9 
 
 		 678 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  25.27 
 
 		 709 aa  90.9  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 680 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 729 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 718 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  26.8 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 680 aa  74.7  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  29.49 
 
 		 687 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  24.51 
 
 		 734 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  32.11 
 
 		 764 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  28.5 
 
 		 782 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 452 aa  51.2  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  27.67 
 
 		 794 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 487 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000131529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  23.17 
 
 		 406 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3502  hypothetical protein  29.24 
 
 		 527 aa  44.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.7799500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 692 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>