31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2725 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  73.64 
 
 
794 aa  1115    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  100 
 
 
782 aa  1551    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  45.7 
 
 
764 aa  541  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  31.46 
 
 
734 aa  293  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
729 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 
680 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
680 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
718 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  27.94 
 
 
710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  24.72 
 
 
678 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  27.18 
 
 
687 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
686 aa  88.2  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  25.34 
 
 
699 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  27.2 
 
 
725 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  30.45 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  21.63 
 
 
408 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  28.64 
 
 
406 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5398  hypothetical protein  24.42 
 
 
425 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
452 aa  58.5  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  27.09 
 
 
709 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  25.55 
 
 
464 aa  53.5  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1890  hypothetical protein  30.24 
 
 
416 aa  53.9  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0086  hypothetical protein  25.55 
 
 
464 aa  51.6  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
692 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  28.02 
 
 
399 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4800  hypothetical protein  27.55 
 
 
367 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  24.26 
 
 
422 aa  48.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3946  hypothetical protein  26.4 
 
 
430 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0127  hypothetical protein  23.74 
 
 
449 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5609  hypothetical protein  20.53 
 
 
423 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1601  hypothetical protein  25.98 
 
 
649 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.398163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>