33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2726 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
687 aa  1353    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  76.56 
 
 
686 aa  1016    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  47.67 
 
 
710 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
692 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  29.07 
 
 
678 aa  177  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 
680 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  29.22 
 
 
709 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
729 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
718 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  27.95 
 
 
725 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
680 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  26.81 
 
 
734 aa  130  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  25.5 
 
 
764 aa  110  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  26.45 
 
 
794 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  28.43 
 
 
699 aa  104  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  26.36 
 
 
782 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3887  hypothetical protein  29.49 
 
 
756 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  23.63 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  33.58 
 
 
705 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3053  hypothetical protein  24.09 
 
 
419 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  25.28 
 
 
464 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4609  hypothetical protein  26.34 
 
 
417 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0086  hypothetical protein  25.65 
 
 
464 aa  51.6  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  28.99 
 
 
826 aa  50.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
452 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0341  hypothetical protein  25.63 
 
 
417 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  27.57 
 
 
399 aa  48.5  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4917  hypothetical protein  25.13 
 
 
417 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4932  hypothetical protein  25.13 
 
 
417 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  26.55 
 
 
463 aa  47  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.14 
 
 
408 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 
245 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3452  hypothetical protein  23.76 
 
 
417 aa  44.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>