56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2397 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  809    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  32.57 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  33.25 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3053  hypothetical protein  29.78 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5398  hypothetical protein  31.94 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5609  hypothetical protein  33.77 
 
 		 423 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3946  hypothetical protein  30.95 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0094  hypothetical protein  34.17 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  30.23 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0313  hypothetical protein  25.07 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1890  hypothetical protein  26.77 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3452  hypothetical protein  28.45 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0127  hypothetical protein  24.72 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4609  hypothetical protein  29.21 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0341  hypothetical protein  26.25 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4917  hypothetical protein  28.87 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4932  hypothetical protein  28.87 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2611  hypothetical protein  25.13 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 685 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  29.69 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0876  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000359561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  24.25 
 
 		 687 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0062  hypothetical membrane spanning protein  36.65 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139951  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2032  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.65 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  26.67 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0086  hypothetical protein  26.67 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  25.1 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  29.01 
 
 		 764 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0389  hypothetical protein  31.12 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000244478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  27.54 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3730  hypothetical protein  29.74 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000494376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1056  hypothetical protein  22.73 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  30.09 
 
 		 1391 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  24.69 
 
 		 553 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  26.83 
 
 		 699 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  25.47 
 
 		 678 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 680 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 729 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0396  hypothetical protein  22.78 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 553 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2702  hypothetical protein  20.27 
 
 		 483 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.050547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  27.86 
 
 		 734 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5551  hypothetical protein  38.78 
 
 		 80 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4727  hypothetical protein  22.31 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3502  hypothetical protein  30.59 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.7799500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5525  hypothetical protein  24.72 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  24.89 
 
 		 709 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0386  hypothetical protein  24.03 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  22.5 
 
 		 528 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5126  hypothetical protein  26.22 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.05 
 
 		 550 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4800  hypothetical protein  27.09 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>