36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2727 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
729 aa  1442    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  76.08 
 
 
718 aa  988    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.29 
 
 
680 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  39.4 
 
 
680 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  30.72 
 
 
794 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  31.31 
 
 
710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  29.22 
 
 
782 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
686 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  30.54 
 
 
687 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  28.55 
 
 
734 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  27.94 
 
 
678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  28.46 
 
 
699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  36.86 
 
 
764 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  28.43 
 
 
709 aa  111  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
692 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  26.72 
 
 
725 aa  90.9  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3887  hypothetical protein  26.54 
 
 
756 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2825  hypothetical protein  28.63 
 
 
942 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3113  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
610 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.264038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2611  hypothetical protein  28.15 
 
 
441 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  28.18 
 
 
406 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  25.21 
 
 
463 aa  52  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  25.1 
 
 
464 aa  51.6  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0086  hypothetical protein  25.1 
 
 
464 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  29.76 
 
 
399 aa  48.5  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  21.88 
 
 
422 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4800  hypothetical protein  26.14 
 
 
367 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1890  hypothetical protein  28.98 
 
 
416 aa  45.8  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
586 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
685 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5398  hypothetical protein  25.88 
 
 
425 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2959  hypothetical protein  28.85 
 
 
946 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.941991  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0876  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
430 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000359561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.21 
 
 
408 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3053  hypothetical protein  25.24 
 
 
419 aa  44.3  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>