More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0351 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0351  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 455 aa  909    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  89.23 
 
 		 455 aa  799    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0061  Phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.490327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4460  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.09 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.02 
 
 		 419 aa  236  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.46 
 
 		 425 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.36 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.54 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.6 
 
 		 591 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.24 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.02 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.73 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.97 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.04 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.51 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.2 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.31 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.24 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.8 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.8 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.24 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.67 
 
 		 426 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.88 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.21 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.25 
 
 		 427 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.01 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.29 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.59 
 
 		 428 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.24 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.18 
 
 		 430 aa  206  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.74 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.11 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.88 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.09 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.6 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  31 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.01 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.74 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.1 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.52 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.43 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.63 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.09 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.09 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.53 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.43 
 
 		 424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.2 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  30.07 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.52 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.29 
 
 		 423 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 		 425 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 		 425 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.74 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.61 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.41 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.41 
 
 		 430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.03 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.63 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.07 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.5 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.7 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.15 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.09 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.34 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.81 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.07 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.24 
 
 		 425 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.3 
 
 		 704 aa  196  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.52 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.48 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.22 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.03 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.04 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.52 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.29 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.81 
 
 		 425 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.68 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.45 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.22 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.38 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  30.04 
 
 		 809 aa  192  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.42 
 
 		 421 aa  192  8e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.32 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.91 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  31 
 
 		 425 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.3 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.27 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  30 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.06 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.24 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.63 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.39 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.22 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.48 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.61 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>