28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5933 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  59.57 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  60 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  60.45 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  39.01 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  44.29 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  39.42 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  36.65 
 
 		 270 aa  141  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  37.71 
 
 		 313 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  40.8 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  34.3 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  39.39 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  34.13 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  34.62 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  30.9 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  31.19 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  30.89 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  30.85 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  30.61 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  32.95 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  29.95 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  27.02 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  28.15 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  27.36 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  27.36 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  28.16 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  26.71 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  27.56 
 
 		 242 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>