31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1169 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  52.17 
 
 		 243 aa  238  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  53.11 
 
 		 211 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  52.02 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  48.58 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  41.71 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  43.41 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  36.53 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  41.09 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  39.02 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  38.54 
 
 		 248 aa  134  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  34.62 
 
 		 247 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  36.68 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  32.87 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  33.51 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  32.7 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  30.85 
 
 		 263 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  34.33 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  31.13 
 
 		 270 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  28.5 
 
 		 313 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  33.84 
 
 		 256 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  33.09 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  24.74 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0156  hypothetical protein  26.58 
 
 		 409 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1088  hypothetical protein  23.08 
 
 		 390 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2513  hypothetical protein  26.42 
 
 		 354 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494464  normal  0.393755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>