29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3009 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  65.47 
 
 		 306 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  46.55 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  45.92 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  46.7 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  40.38 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  42 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  42.38 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  42.33 
 
 		 242 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  44.29 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  42.16 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  36.94 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  33.48 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  32.66 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  29.95 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  31.58 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  31.13 
 
 		 212 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  27.84 
 
 		 211 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  31 
 
 		 237 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  27.49 
 
 		 210 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  27.84 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  27.49 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  27.62 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  26.67 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  30.87 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  24.4 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1088  hypothetical protein  31.82 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>