27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6358 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  524  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  77.38 
 
 		 256 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  72.05 
 
 		 256 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  58.51 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  38.58 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  39.55 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  42.16 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  42.16 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  40.8 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  41.18 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  40.5 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  37.81 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  33.17 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  33.18 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  28.28 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  33.84 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  30.63 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  31.75 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  28.86 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  32.2 
 
 		 228 aa  95.5  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  28.88 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  28.71 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  27.92 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  27.92 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  27.47 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  38.81 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>