28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1706 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  54.89 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  40.38 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  36.47 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  32.87 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  31.53 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  30.54 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  29.85 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  33.14 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  37.67 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  31.58 
 
 		 313 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  27.8 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  32.84 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  33 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  32.79 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  29.27 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  34.68 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  35.84 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  33.97 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  31 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  88.6  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  32.95 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  30.97 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  31.87 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  26.63 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  28.21 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>