27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6359 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  77.38 
 
 
256 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  68.75 
 
 
256 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  57.68 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  40.38 
 
 
270 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  41.36 
 
 
265 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  37.11 
 
 
270 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  37.98 
 
 
306 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  41.46 
 
 
313 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  40.2 
 
 
242 aa  144  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  39.04 
 
 
263 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  36.89 
 
 
266 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  35.1 
 
 
240 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  33.8 
 
 
282 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  29.29 
 
 
248 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  33.51 
 
 
212 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  30.04 
 
 
222 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  30.54 
 
 
237 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  31.84 
 
 
211 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  30.63 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  30.2 
 
 
222 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  30.65 
 
 
243 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  31.18 
 
 
209 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  30.65 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  29.19 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  27.17 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  36.92 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>