31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1876 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  44.34 
 
 		 228 aa  194  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  44.2 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  41.71 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  39.53 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  39.07 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  38.64 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  41.63 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  42.49 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  27.73 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  26.92 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  30.2 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  27.78 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  28.5 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  27.02 
 
 		 247 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  27.84 
 
 		 270 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  26.45 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  30.97 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  27.18 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  25.86 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  27.92 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  29.23 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  28.64 
 
 		 313 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  28.9 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  28.71 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  24.84 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2513  hypothetical protein  29.71 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494464  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0156  hypothetical protein  28.18 
 
 		 409 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1088  hypothetical protein  28.68 
 
 		 390 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  22.53 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  26.88 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>