28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1613 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  44.34 
 
 
222 aa  194  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  41.09 
 
 
222 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  42.72 
 
 
243 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  43.41 
 
 
212 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  41.35 
 
 
221 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  37.07 
 
 
211 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  39.77 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  40.35 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  40.7 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  34.44 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  35.48 
 
 
266 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  30.51 
 
 
256 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  33.97 
 
 
237 aa  89.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  31.89 
 
 
306 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  28.85 
 
 
313 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  29.95 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  29.19 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  31.35 
 
 
265 aa  82  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  27.62 
 
 
270 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  27.72 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  32.2 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  23.44 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  28.04 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  25.52 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  24.5 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5244  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.58 
 
 
514 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>