29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3121 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  52 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  47.9 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  46.7 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  47.21 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  35.8 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  38.5 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  43.65 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  41.08 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  39.04 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  40.8 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  41.18 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  30.8 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  34.76 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  30.37 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  35.61 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  30.85 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  31.72 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  27.67 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  28.32 
 
 		 209 aa  89  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  26.45 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  27.88 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  31.87 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  25.52 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  21.25 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2513  hypothetical protein  35.62 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494464  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  28.03 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>