20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4215 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  31.51 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  30.87 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  27.52 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  27.82 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  27.92 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  30.11 
 
 		 282 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  30.41 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  23.19 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  26.59 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  26.63 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  23.7 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  24.1 
 
 		 313 aa  45.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  24.5 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  26.71 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  26.88 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  28.03 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>