30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0748 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  53.96 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  47.9 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  42 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  41.75 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  42.86 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  41.46 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  39.53 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  37.71 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  36.04 
 
 		 240 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  40.8 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  29.57 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  31.78 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  34.18 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  31.58 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  27.53 
 
 		 248 aa  95.9  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  30.1 
 
 		 211 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  28.85 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  28 
 
 		 210 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  28.06 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  28.64 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  28.74 
 
 		 242 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  21.97 
 
 		 221 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  24.1 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2513  hypothetical protein  30 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494464  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1088  hypothetical protein  22.09 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>