25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2740 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  33.09 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  27.59 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  28.74 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  29.59 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  24.14 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  26.01 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  27.52 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  31.37 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  28.74 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  40.58 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  26.35 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  22.59 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  28.93 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  23.11 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1088  hypothetical protein  26.37 
 
 		 390 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  37.04 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  26.11 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  24.66 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  24.02 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0156  hypothetical protein  27.67 
 
 		 409 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  27.56 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>