47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3561 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  100 
 
 		 276 aa  563  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  67.98 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  65.19 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  65.19 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  64.61 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  53.55 
 
 		 199 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  54.44 
 
 		 196 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  53.89 
 
 		 196 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  53.89 
 
 		 196 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  53.89 
 
 		 196 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  55.95 
 
 		 197 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  55.95 
 
 		 197 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  56.44 
 
 		 196 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  52.78 
 
 		 196 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  52.46 
 
 		 199 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  45.54 
 
 		 203 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  43.01 
 
 		 193 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  46.43 
 
 		 180 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  40.33 
 
 		 179 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4435  putative proline rich signal peptide protein  41.72 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  40.69 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  37.69 
 
 		 205 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  35.78 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  37.02 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  38.15 
 
 		 202 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  37.02 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  36.71 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  35.29 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  36.69 
 
 		 187 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  36.31 
 
 		 215 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  41.03 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  37.66 
 
 		 200 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  33.54 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  28.89 
 
 		 196 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  26.49 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  26.63 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2270  conserved hypothetical protein, proline rich; putative membrane anchored protein  28.72 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  21.52 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>