49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2280 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  98.47 
 
 
196 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  87.24 
 
 
196 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  87.24 
 
 
196 aa  354  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  87.24 
 
 
196 aa  353  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  87.24 
 
 
196 aa  353  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  87.24 
 
 
196 aa  353  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  80.9 
 
 
199 aa  337  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  80.4 
 
 
199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  84.18 
 
 
196 aa  322  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  86.8 
 
 
197 aa  320  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  86.8 
 
 
197 aa  320  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  59.15 
 
 
291 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  56.14 
 
 
256 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  55.15 
 
 
276 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  53.85 
 
 
256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  52.46 
 
 
256 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  44.89 
 
 
193 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  48.75 
 
 
180 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  46.82 
 
 
203 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  40.91 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  38.27 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  38.42 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  35 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  36.75 
 
 
202 aa  111  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  36.97 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  34.86 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  32.28 
 
 
215 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  31.77 
 
 
219 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  31.03 
 
 
203 aa  98.2  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  32.89 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4435  putative proline rich signal peptide protein  30.92 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  35.33 
 
 
189 aa  95.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  28.09 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  30.05 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  29.21 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  28.85 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0190  hypothetical protein  23.4 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  21.15 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  24.7 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2737  hypothetical protein  23.28 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000335413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2270  conserved hypothetical protein, proline rich; putative membrane anchored protein  27.22 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>