48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1774 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  79.44 
 
 		 193 aa  303  9.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  49.07 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  48.45 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  48.45 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  48.45 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  47.2 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  49.38 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  46.88 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  47.83 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  47.83 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  46.51 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  45.51 
 
 		 256 aa  168  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  46.2 
 
 		 256 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  48.75 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  48.75 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  48.75 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  48.75 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  48.75 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  48.75 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  48.75 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  46.91 
 
 		 291 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  46.91 
 
 		 276 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  43.56 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  42.94 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  42.77 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  41.18 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  37.87 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  36.47 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  36.08 
 
 		 203 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  34.55 
 
 		 219 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4435  putative proline rich signal peptide protein  32.95 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  34.18 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  32.5 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  32.56 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  31.21 
 
 		 223 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  31.21 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  30.19 
 
 		 203 aa  94.4  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  34.29 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  24.54 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  26.16 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0190  hypothetical protein  25.29 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  29.5 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  23.57 
 
 		 210 aa  51.6  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  20.48 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2270  conserved hypothetical protein, proline rich; putative membrane anchored protein  25.75 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>